Deep Learning Image Reconstruction to Improve Computed Tomography Image Quality of the Phantom with Standard Liver Density
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摘要:
目的:通过使用不同的扫描剂量,扫描模拟标准肝脏密度体模,比较深度学习重建技术(DLIR)与自适应统计迭代重建技术(ASIR-V)重建图像的质量。方法:使用Gammex标准CT体模模拟标准肝脏密度的插入物(ρew=1.06),在6种不同辐射剂量水平(CTDIvol:30、20、15、10、7.5和4.5mGy)下进行CT扫描。随后,使用DLIR和ASIR-V算法,对每种剂量下获得的图像进行重建。通过imQuest软件对图像进行质量分析,使用Bland-Altman方法比较DLIR算法在4.5mGy(本实验采用的最低辐射剂量)和ASIR-V在15mGy(肝脏扫描推荐剂量)下的图像质量。结果:在6种剂量水平下,DLIR在噪声(P<0.001)、信噪比(P<0.001)、对比噪声比(P<0.001)和可检测度(P<0.001)等关键指标上,均显著优于ASIR-V。Bland-Altman分析结果表明,在4.5mGy的剂量水平下,DLIR的图像质量显著优于ASIR-V在15mGy剂量水平下的表现。在4.5mGy下DLIR图像的噪声为17.41±0.32,显著低于ASIR-V在15mGy的21.17±0.67(P<0.001)。在4.5mGy下DLIR的信噪比、对比噪声比和可检测度分别为3.21±0.24,3.42±0.35和8.81±0.63,显著高于ASIR-V在15mGy剂量下的2.69±0.14,2.87±0.11和5.61±1.28(P值分别为0.006、0.029和0.005)。结论:在模拟标准肝脏密度的局灶性病变体模CT扫描实验中,DLIR相较于ASIR-V,不仅显著提升信噪比,对比噪声比和可检测度值,而且大幅度降低图像噪声。DLIR技术能够在4.5mGy的较低辐射剂量下,实现优于常规15mGy剂量下ASIR-V重建图像的质量效果。
Abstract:Objective: This study aimed to compare the quality of reconstructed images by deep learning image reconstruction (DLIR) and adaptive statistical iterative reconstruction-V (ASIR-V) techniques at different scan doses using a phantom with liver density. Methods: The Gammex computed tomography (CT) phantom with a standard liver-density insert (ρew=1.06) was scanned at six different radiation doses (CTDIvol; 30, 20, 15, 10, 7.5, and 4.5 mGy). Images obtained at each dose were reconstructed using DLIR and ASIR-V. Image quality was analyzed through the imQuest software. The quality of reconstructed images by DLIR at 4.5 mGy (lowest radiation dose) and ASIR-V at 15 mGy (recommended scan dose) were compared using the Bland–Altman method. Results: Across the six doses, DLIR significantly outperformed ASIR-V in key metrics, such as noise (P<0.001), signal-to-noise ratio (SNR) (P<0.001), contrast-to-noise ratio (CNR) (P<0.001), and detectability index (d') (P<0.001). Bland–Altman analysis indicated that the quality of reconstructed images by DLIR at 4.5 mGy was significantly better to those by ASIR-V at 15 mGy. The noise level of DLIR images at 4.5 mGy was 17.41±0.32, which is significantly lower than that of ASIR-V at 15 mGy (21.17±0.67) (P<0.001). At 4.5 mGy, DLIR SNR, CNR, and d' were 3.21±0.24, 3.42±0.35, and 8.81±0.63, respectively, which are significantly higher than that of ASIR-V at 15 mGy (2.69±0.14, 2.87±0.11, and 5.61±1.28, respectively) (P=0.006, 0.029, and 0.005 respectively). Conclusion: In CT scan of focal liver-density lesions using a phantom, DLIR significantly improved the SNR, CNR, and d' values and reduced image noise compared to ASIR-V. DLIR was able to achieve better quality image reconstruction at 4.5 mGy than the conventional ASIR-V reconstruction at 15 mGy.
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Keywords:
- CT /
- deep learning /
- phantom /
- radiation dose
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新型冠状病毒感染(coronavirus disease 2019,COVID-19)疫情自2019年底开始的在世界各国频发,成为全球性的重大公共卫生事件。随着我国防控政策的科学调整[1],“保健康、防重症”成为现阶段常态化防控的工作重心。医生在诊断过程中面临着门诊患者流行病学史越来越模糊的局面。COVID-19的诊断主要依赖核酸检测与CT;相比核酸检测用时较长且存在假阴性等缺点,胸部CT具有实时性高、敏感性好、不易漏诊等优势,特别胸部薄层平扫CT可在COVID-19的早期发现病灶、精准诊断和鉴别、评判临床分期和疗效预后等方面提供重要影像依据[2-3]。既往胸部CT分析主要依靠诊断医生肉眼主观视觉评估,缺乏客观依据。近年来深度学习定量分析软件不断优化,为客观评估病灶性质提供了新的途径,其能够准确分割病灶并计算病灶体积、密度以及病灶非实性占比等多种参数。
本研究回顾性分析就诊的COVID-19患者的胸部CT资料,通过深度学习肺炎定量工具客观地对肺内病变进行多参数定量分析,探讨病变演变规律,为预后判断提供客观依据。
1. 资料与方法
1.1 病例资料
参照国家卫生健康委员会《新型冠状病毒感染诊疗方案(试行第十版)》[4]胸部影像学部分,回顾性分析内蒙古自治区人民医院2022年12月1日至2022年12月31日感染奥密克戎(Omicron)BF.7的477例COVID-19患者,男性276例(57.9%),女性201例(42.1%),均有流行病学史,初诊时发热466例,咳嗽114例。根据是否转为重症(重型/危重型)分为A组(未转为重症)、B组(转为重症)。
纳入标准:临床资料完善;首诊为COVID-19临床分型中型且影像资料完整、图像无伪影病例。排除标准:首诊为临床分型轻型、重型、危重型COVID-19本土病例及图像伪影重,AI无法识别者;无薄层图像者。
1.2 影像检查方法
使用GE LightSpeed VCT 64排CT机。扫描参数:管电压120 kV,管电流自动毫安输出,正常体型设置为60~80 mAs,层厚5.00 mm,重建层厚1.25 mm,层间距1 mm,矩阵512×512。所有患者均采取仰卧位,深吸气后屏气状态下由肺尖至肺底扫描。
1.3 CT图像分析及模型检测
将胸部CT图像导入AI肺炎辅助诊断系统(北京推想科技有限公司,Inferead CT Pneumonia)进行处理,该系统利用迁移学习技术及标记好的COVID-19数据进行训练,然后自动划分肺叶,通过深度学习分割模型对肺病灶区域进行勾画并测量肺炎病灶的密度、体积及肺炎病灶的体积占肺叶及整肺体积的百分比。
1.4 资料分析
由影像医学科胸组两位具有丰富工作经验的副主任医师双盲独立阅片,对胸部CT图像病灶分布、形态、组成、胸腔积液及纵隔淋巴结情况及对基于人工智能标注的结果进行校对、修正、补充。意见不一致时由第3位胸组主任医师加入协商,达成一致。
1.5 统计学方法
统计学分析采用SPSS 22.0软件。经正态性检验,数据不服从正态分布,采用中位数(四分位间距描述);A组(未转为重症)与B组(转为重症)两组比较时采用非参数Kruskal-Wallis检验及Mann-Whitney U检验;检验水准α=0.05,以P≤0.05为差异具有统计学意义。
2. 结果
2.1 患者分组情况
A组患者450人,男女比(260/190),B组患者27人,男女比(16/11),两组患者性别比例差异无统计学意义;A组患者平均年龄(68.4±14.5)岁,B组患者平均年龄(72.7±13.0)岁,两组患者年龄差异无统计学意义;A组和B组患者胸部CT图像进行AI深度学习定量分析。
2.2 病灶体积、密度及占比特点
本研究应用北京推想科技有限公司的AI肺炎辅助诊断系统对两组新型冠状病毒奥密克戎变异株感染患者胸部CT的炎症病灶进行勾画,并计算全肺及各肺叶炎症病灶体积及占比(图1)。
B组全肺及各肺叶(右肺上叶、中叶、下叶及左肺上叶、下叶)病灶体积及体积占比高于A组。A组病灶以右肺下叶为主,占比较其它肺叶高,达3.32%;其次为左肺下叶,占比为2.08%;左肺上叶病灶体积占比较其他肺叶低,仅为0.25%。A组部分患者右肺上叶、右肺中叶及左肺上叶无病灶。B组病灶呈双肺分布,各肺叶均有分布;其中以右肺下叶、左肺下叶分布为主,占比最高,分别为57.86% 和54.76%;右肺中叶体积占比较其他肺叶低,为34.73%(表1)。
表 1 A组和B组全肺及各肺叶病灶体积及体积占比Table 1. The lesion volume and proportion of the whole lung and each lung lobe in groups A and B指标 组别 统计检验 A组(n=450) B组(n=27) Z P 全肺病灶体积占比/% 2.43(0.45~7.43) 40.45(33.47~46.60) 75.868 <0.001 全肺病灶体积 87.12(17.73~262.20) 1239.21(841.54~1395.12) 72.842 <0.001 右肺上叶病灶体积占比/% 0.50(0~3.00) 35.70(20.84~50.32) 69.027 <0.001 右肺上叶病灶体积 4.56(0~24.22) 225.10(120.17~317.48) 64.978 <0.001 右肺中叶病灶体积占比/% 0.53(0~4.45) 34.73(20.29~51.61) 64.665 <0.001 右肺中叶病灶体积 1.87(0~12.77) 101.87(54.41~153.72) 62.733 <0.001 右肺下叶病灶体积占比/% 3.32(0.42~14.45) 57.96(38.89~63.36) 67.346 <0.001 右肺下叶病灶体积 28.11(3.75~86.83) 292.99(219.19~430.41) 62.544 <0.001 左肺上叶病灶体积占比/% 0.25(0~2.49) 36.66(19.28~53.40) 72.725 <0.001 左肺上叶病灶体积 2.46(0~22.60) 217.79(128.16~347.07) 70.645 <0.001 左肺下叶病灶体积占比/% 2.08(0.20~12.09) 54.76(37.02~64.50) 57.120 <0.001 左肺下叶病灶体积 15.62(1.64~73.52) 283.51(168.11~329.39) 53.018 <0.001 各组病灶均以磨玻璃密度影(ground glass opacity,GGO)为主,A组以密度为 -570~-470 HU病灶为主,占比达13.89%;其次为 -470~-370 HU,占比为11.07%;密度为30~70 HU实性病灶及密度为 -70~30 HU较少,占比仅3.22%、4.75%。B组大部分呈磨玻璃密度影,以病灶密度为 -570~-470 HU、-470~-370 HU与 -370~-270 HU为主,占比分别为13.18%、12.58% 和12.52%。A组和B组密度为 -570~-470 HU的病灶占比差异无统计学意义。余各密度病灶体积及体积占比高于A组,呈病灶密度越高,B组占比较A组越高的趋势(表2)。
表 2 A组和B组病灶密度及各密度病灶体积占比Table 2. Lesion densities and volume proportion of each density in groups A and B病灶密度(HU)及占比 组别 统计检验 A组 B组 Z P -570~-470体积 12.15(2.46~35.315) 141.75(101.24~197.83) 70.193 <0.001 -570~-470体积占比/% 13.89(11.38~16.24) 13.18(11.11~15.10) 0.662 0.416 -470~-370体积 9.79(1.91~28.07) 144.65(113.14~181.30) 73.162 <0.001 -470~-370体积占比/% 11.07(8.58~13.55) 12.58(10.80~15.05) 8.352 0.004 -370~-270体积 7.42(1.37~21.21) 125.49(100.26~174.70) 73.630 <0.001 -370~-270体积占比/% 8.48(6.12~10.93) 12.52(9.88~15.32) 22.392 <0.001 -270~-170体积 5.28(1.03~15.84) 107.73(84.18~174.06) 72.647 <0.001 -270~-170体积占比/% 6.27(4.32~8.95) 10.10(8.18~14.70) 22.871 <0.001 -170~-70体积 3.76(0.72~12.42) 88.10(55.36~146.54) 68.923 <0.001 -170~-70体积占比/% 4.75(2.76~7.27) 7.69(6.34~11.04) 17.093 <0.001 -70~30体积 2.33(0.44~9.57) 62.38(29.04~83.22) 63.385 <0.001 -70~30体积占比/% 3.22(1.49~5.77) 5.25(3.41~6.60) 9.336 0.002 30~70体积 0.47(0.05~2.08) 10.84(5.74~18.90) 57.192 <0.001 30~70体积占比/% 0.60(0.18~1.50) 1.27(0.60~1.63) 5.928 0.015 其他 39.63(8.42~110.95) 307.92(250.60~534.06) 57.426 <0.001 其他占比/% 47.91(35.69~59.69) 36.02(23.45~42.65) 16.879 <0.001 2.3 病灶影像征象
A组主要表现为单个(图2和图3)或2个及2个以上肺叶(图4、图5和图7)大小不等片状磨玻璃阴影、实变影,部分较淡薄,胸膜下、肺叶外周带分布多见(图3~图5和图7),右肺中叶受累相对少见,病灶形态呈不规则斑片状、小片状、条片状,也可呈边缘模糊、伴有晕征的小叶中心结节(图2~图7),无胸腔积液及淋巴结肿大。
B组呈双肺广泛分布的GGO、网状结构、条索、微囊性改变或混合表现,更容易出现的特征为实性病灶或实性病灶与磨玻璃病灶并存、铺路石征、支气管充气征、支气管壁增厚、牵连性支气管扩张、胸膜下线、血管增粗等,病变密度较高,实变范围较大,大多沿支气管血管束及胸膜下、肺外带分布为主(图7)。
3. 讨论
COVID-19主要传播途径为呼吸道传播[5-6],传染性较高,人群普遍易感,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)变异影响病毒与人体细胞的亲和力,改变病毒的传染性和致病性。Omicron变异株由于传染和免疫逃避能力增强,成为全球流行优势毒株,其致病力较早期毒株明显下降,但仍有部分患者迅速进展为重症。
2022年12月《关于进一步优化落实新冠肺炎疫情防控措施的通知》、《关于印发对新型冠状病毒感染实施“乙类乙管”总体方案的通知》陆续发布,我国的新型冠状病毒感染疫情防控“关口前移”,基层医疗机构面临感染人数突增、重症患者明显增多、医护人员大面积感染等问题,重症患者的救治成为医务人员的工作重点。胸部CT平扫快捷、高效,在COVID-19排查及病情评估中具有不可替代的作用,特别是薄层高分辨率CT可准确显示肺部病灶的细微结构,是当前筛查与鉴别COVID-19的重要手段之一[7]。
COVID-19胸部CT表现多为肺外带、胸膜下的磨玻璃斑片影或磨玻璃结节,较重者表现为双肺多发实变影,体积较大,双肺广泛实变者形成白肺。COVID-19重症患者病情危重、进展迅速,缺乏有效的治疗手段,病死率较高;早期评估COVID-19肺部病变体积、密度等参数可为临床治疗提供依据;然而预测COVID-19是否会进展为重症具有挑战性。客观准确的认识对判断疾病的预后至关重要,而既往影像诊断医师对病变的认识多依赖于主观经验,近年来随着空间识别能力强大的深度学习与医学影像技术的结合,可以从原始图像自适应学习识别并提取高层特征,并不断进行自我学习,优化读片效果,疾病诊断能力取得了突破性的进展[8]。
深度学习可定量分析针对COVID-19的胸部CT表现进行算法的迭代和优化,通过计算肺炎病灶的密度、体积及占比来判断病变的严重程度,可对病灶范围及严重程度进行量化。有研究表明目前已开发的COVID-19相关AI模型诊断准确率可达94.00%~95.24%[9];Yang等[10]的研究显示深度学习可识别 COVID-19并与细菌性肺炎相鉴别,灵敏度达96%;有研究[11]利用AI系统及CT影像和临床数据成功地预测了患者进展为重症的时间,对患者进行准确分类并确定了高危患者,具有进行个性化治疗的潜在价值。
本研究中A组450例患者胸部CT多呈双肺多叶段分布边缘模糊的GGO,也可呈伴有晕征的小叶中心结节,可能原因为肺泡内渗出和水肿并不明显[12];部分可见小血管增粗、局部小叶间隔网格状增厚及空气支气管征,原因为不同程度的弥漫性肺泡损伤,可能由炎性细胞因子风暴引起[13];病灶多以胸膜下肺外周分布为主是由于新冠病毒颗粒小,经呼吸道吸入后直达肺泡位置,胸膜下区是肺的最末梢结构,病毒与该区域的Ⅱ型肺泡上皮细胞结合,引起肺泡壁损伤;病灶密度为磨玻璃最多,依次为实性周围磨玻璃影、实性,也可各种征象共存,可能原因[14-17]是肺泡上皮受到病毒侵犯,炎症及渗出液导致肺泡间隔增厚、肺泡部分萎陷。本研究中,非重症组更容易出现的CT征象为磨玻璃密度结节,甚至结节边缘可见毛刺、与邻近胸膜牵拉,需通过复查与周围型肺癌鉴别。
转为重症的B组胸部CT多表现为以双肺多叶受累、弥漫分布的实变影合并GGO,可见多发条索及空气支气管征,同之前的研究一致[18],感染肺叶数以及各肺叶感染体积占比、总感染体积占比均高于A组,且病灶累及肺叶较A组多,各肺叶感染体积及双肺感染总体积均高于A组。吸收后胸部CT表现为轻微的胸膜下网状结构、磨玻璃影或两者都有。A组和B组均未见胸腔积液与纵隔、肺门淋巴结肿大。以上结果表明感染肺叶数多、病变以弥漫性实变为主,感染体积较大、占比较高者,容易转为重症。非重症组和重症组无明显差异的CT征象包括磨玻璃病灶、小叶间隔增厚、网状改变、胸膜下分布分布。
综上,病灶分布、病灶成分、CT征象在新型冠状病毒感染未转为重症组和转为重症组间具有显著差异,转为重症组更易出现实性病灶、磨玻璃与实性混合型病灶、铺路石征、血管增粗等多种征象并存的现象。应用深度学习定量测量技术准确分析病灶可对COVID-19的预后提前做出判断,指导临床及早调整治疗策略,起到预警重症作用。
现阶段COVID-19主要需结合流行病学与甲型H1N1流感鉴别。甲型H1N1流感致急性肺损伤很少见到磨玻璃密度向肺实变密度发展,一般经治疗后均逐渐消失[19],且大部分消散较快。有研究认为,磨玻璃影、实变和支气管增厚是甲型流感肺炎的常见HRCT影像学表现,但无小叶间隔增厚[2,7,20]。在COVID-19疫情暴发期间,大多数病毒性肺炎是由COVID-19引起,胸部CT筛查行之有效。在非流行期胸部CT可以用来判断患者是否感染了病毒性肺炎,而由哪种病毒引起单纯通过影像明确诊断较为困难。因此在COVID-19流行期基于深度学习建立的胸部CT诊断模型可快速有效筛查COVID-19。
本研究的局限性:①病例均来自于门诊,未纳入发热后未至医院行CT检查的病例及胸部CT无肺炎表现的轻型COVID-19病例,且本研究去除了由于图像缺陷未能进行病灶的AI定量分析的病例,可能存在病例选择性偏倚;②肺炎 AI定量工具准确性仍需进一步验证。
综上所述,感染体积较大、病灶偏实性及多种CT征象并存常提示肺部炎症较重,容易进展为重症。基于深度学习的COVID-19肺炎定量工具能够客观分析胸部CT病灶,较为精确的评估病变严重程度,对有重症转归倾向的病例可起到预警作用,有利于指导临床进一步预测病情发展、制定合理的诊疗方案。
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表 1 CT设备的参数
Table 1 Parameters of CT Equipment
变量 参数 管电压 120 kVp 层厚 1.25 mm 辐射剂量 CTDIvol 30、20、15、10、7.5、4.5 mGy 视野 30.0 cm×30.0 cm 重建图像矩阵 512×512 重建算法 ASIR-V-50%,DLIR-H 表 2 在不同辐射剂量下,DLIR与ASIR-V算法重建图像的测量值比较
Table 2 Comparison of measurements of reconstructed images by DLIR and ASIR-V algorithms at different radiation doses
CTDIvol/mGy CT value(P=0.001) Noise(P<0.001) SNR(P<0.001) CNR(P<0.001) DLIR ASIR-V DLIR ASIR-V DLIR ASIR-V DLIR ASIR-V 30 62.66±3.17 62.06±3.55 11.12±0.69 17.19±1.05 5.65±0.38 3.62±0.19 5.3±0.12 3.69±0.15 20 55.91±2.08 57.58±2.81 12.15±0.34 19.39±0.33 4.61±0.22 2.97±0.15 4.09±0.26 3.2±0.17 15 55.94±1.7 56.91±2.27 13.66±0.55 21.17±0.67 4.1±0.16 2.69±0.14 3.89±0.26 2.87±0.11 10 55.74±2.18 57.71±3.17 15.18±0.3 24.19±1.06 3.67±0.1 2.39±0.17 3.83±0.33 2.63±0.27 7.5 55.35±2.32 59.86±3.34 15.79±0.57 26.37±1.5 3.51±0.2 2.28±0.24 3.78±0.14 2.44±0.17 4.5 55.88±3.31 59.94±4.77 17.41±0.32 29.33±0.91 3.21±0.24 2.05±0.2 3.42±0.35 2.18±0.3 表 3 在不同辐射剂量下,DLIR与ASIR-V算法重建图像的量化分析比较
Table 3 Comparison of quantitative analysis of reconstructed images by DLIR and ASIR-V algorithms at different radiation doses
CTDIvol/mGy NPS-peak(P<0.001) NPS-fpeak(P=0.379) TTF50%(P=0.61) $d' $(P<0.001) DLIR ASIR-V DLIR ASIR-V DLIR ASIR-V DLIR ASIR-V 30 189.02±34.5 528.47±75.13 0.2±0.07 0.18±0.06 0.52±0.13 0.46±0.08 15.95±2.64 9.16±1.43 20 234.72±6.99 786.15±119.99 0.18±0.06 0.17±0.04 0.47±0.06 0.45±0.05 13.49±1.18 6.93±1.09 15 303.35±25.14 850.79±78.38 0.14±0.07 0.19±0.07 0.42±0.02 0.46±0.06 11.94±2.09 5.61±1.28 10 391.89±36.38 1168.32 ±84.180.15±0.05 0.15±0.04 0.4±0.02 0.44±0.11 9.64±0.72 4.94±0.64 7.5 418.12±63.66 1674.62 ±316.680.12±0.05 0.12±0.03 0.35±0.06 0.35±0.04 10.26±1.84 4.68±0.95 4.5 650.8±151.44 2385.55 ±474.440.09±0.02 0.12±0.04 0.35±0.04 0.3±0.06 8.81±0.63 4.43±0.4 表 4 4.5 mGy剂量下的DLIR图像质量测量值与15 mGy剂量下的ASIR-V图像质量测量值差异性的Bland-Altman分析
Table 4 Bland–Altman analysis of the difference in image quality measurements between DLIR (4.5 mGy) and ASIR-V (15 mGy)
指标 DLIR vs ASIR-V平均值(95%置信区间) CT Value -1.026(-6.450~4.398) Noise -3.758(-5.231~-2.285) SNR 0.522(0.090~0.954) CNR 0.552(0.171~1.274) NPS-peak -200.0(-398.3~-1.681) NPS-fpeak -0.104(-0.254~ 0.0457 )TTF50% -0.110(-0.256~0.036) d’ 3.198(0.638~5.758) -
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